Expedice se snaží rozšířit mezi Wraithy vylepšený retrovirus, ten však nefunguje tak, jak má.

 

---

Sheppard má sen, ale probere se a zjistí, že je s Rononem pohřben pod troskami Michaelovi základny. Sheppard uvízl a je zraněný, ale Ronon je v pořádku. Jinde je zase v pořádku Rodney a Lorne je zraněn. Michael se o tom dovídá a posílá tam křižník. Na Atlantis zjistí od poručíka Edisona, co se stalo, a vypravují záchrannou misi. Po příchodu zachytí 4 známky života a slyší Rodneyho s Lornem, jak volají o pomoc. Musí je rychle vyprostit, než přiletí Michael. Mezitím Michael dělá na Teyle nějaké testy a mluví spolu o synovi. Doráží už na planetu a posílá šipky, aby záchranný tým zajali. Ti nemohou uniknout bránou, ale dostanou se do Jumperu. Přilétá také Daedalus a poškodí motory křižníku, takže nikam neunikne. Když se ale Daedalus snaží transportovat přeživší, musí sklopit štíty, je také poškozen a jsou bezbranní. Vymyslí plán, s F-302 zneškodnit jeho zbraně a Jumperem se dostat na palubu, aby Teylu zachránili. Musí ale jednat rychle, protože štíty už dlouho nevydrží. Podaří se jim proniknout na palubu, ale Rodney zjistí, že mají opravy skoro hotové. Nachází Teylu, která ale začíná rodit, tak s ní Rodney zůstane a Sheppard s Rononem musí s C4 do strojovny vyhodit do vzduchu motory. To se jim podaří a Michael zjistí, že jsou na palubě. McKay zatím porodí dítě a pak jdou společně k Jumperu, ale není tam. Musí najít jiný způsob, jak se dostat z lodi…

---

Na Atlantis čekají na Richarda Woolseyho, nového velitele Atlantis, ale moc hezky se k nim nechová. Mezitím Kellerová se probouzí a všimne si, že na její pravé ruce je nějaká želatinová břečka. Rychle to umyje a spí dál. Ostatní se setkávají v konferenční místnosti s Woolseym, kde vyměnil stůl. Sheppard s ním řeší, proč byla Carterová vyměněna, když měla úspěchy. Pak přijdou na řadu i témata ostatní, jako co se stalo s Michaelem, dále pak řeší hybridy a v neposlední řadě stav klona Carsona Becketta. Kellerová tvrdí, že něco našla, ale musí to na něm vyzkoušet. Probouzejí ho tedy ze stáze. Beckett se zotavuje a zanedlouho najdou Kellerovou, kterou nemůžou probudit a na břiše má nějaké úponky. Zapojuje se do toho Beckett, který odejme úponek, ale mají problémy ji oživit. Zjistí, že všichni co byli na M2S-445 jsou nakaženi wraithským patogenem a jsou drženi v karanténě, i Carterová v SGC. Beckett posléze zjistí, že patogen je podobný, jako mateřské úly Wraithů a úponky se snaží dostat k energii, aby mohly místo přetvořit. Woolsey ji chce zabít, ale Carson přijde s lékem, který otestují na Sheppardovi, a ten se uzdraví. Pošlou za ní Ronona, aby jí píchl sérum, zpočátku prochází, ale pak si bude muset prostřílet cestu a úponky ho začnou škrtit. Musí to vzít tedy do vlastních rukou John, který si bere Jumper a vletí přímo do věže, kde je Kellerová…

---

Teyla s Rononem si všimnou na zalesněné planetě nějaké zahalené postavy na zemi, a když chtějí pomoci, zjistí, že je to past a omráčí je bývalý přítel Ronona Tyre a bere Ronona na jinou planetu. Na Atlantis pak Teyla navrhne jít na Belkan a najít jiné Sateďany. Tam se od jednoho muže jen dozví, že Tyre byl Wraithy vyhnán za jeho zradu, ale dá jim vědět, jestli něco zjistí. Ronon se mezitím probere vedle Tyra a zjistí, že ho opustili a je závislý na enzymu, proto je mu tak hrozně a tím, že jim Ronona předá, si zaslouží zase jejich přízeň. Přichází Wraithský komandér a začne se na Rononovi krmit. Na Atlantis nakonec dostanou zprávu, že by mohl být na planetě Sarif Sur. Na Sarif Sur Tyre Ronona prosí, aby se podřídil, ale on že radši zemře. Spasení se nakonec nekoná, Tyra tam nechají ve špatném stavu a Ronona si odvádí, protože ho chtějí připoutat na svou stranu. Přichází potom tým a najdou tam Tyra. Berou ho na Atlantis, protože má velké abstinenční příznaky. Nakonec se z toho dostane a řekne jim, kde Ronona drží. Přidá se k nim i Teyla a jdou zachránit Ronona, je ale pozdě, protože se z něj už stal ctitel Wraithů. Dostávají se do zařízení a rozmístí C4. Pak najdou Ronona, ale zjistí, že je s Wraithy a jsou zajati, protože Tyre je zradí. Později se ale ukáže, že je nezradil a pomůže jim s Rononem uniknout, přičemž se obětuje a vyhazuje zařízení do vzduchu. Ronon je poslán na ošetřovnu a musí se z toho dostat…

---

Nad Atlantis se objeví z ničeho nic Daedalus, ale diví se, protože by měl být 2 dny cesty od Země. Letí to prozkoumat Jumperem. Nacházejí vnější poškození a loď je prázdná bez známek života. Rodneymu se podaří zprovoznit nějaké systémy a Teyla najde lodní deník se zprávou, ale plukovníka nepoznávají. Pak rodney i Atlantis zaregistrují zvýšení nějaké energie a zmizí z orbity. Tým najednou nemůže najít Atlantis. McKay si uvědomí, že jsou to podobné známky energie, jako když přicestovala jeho kopie z alternativní reality a posílá tam tým. Nalézají ale sami sebe z alternativní reality mrtví a Rodney si myslí, že když to oni nezvládli, tak jim se to taky nepodaří. Brzy zjistí, že za přechody může nějaký disk, ale nedá se zastavit a zase skočí. Zde už je Atlantis, ale začne na ni střílet nějaká mimozemská loď. Podaří se jim ji poškodit, ale vyšlou na ně stíhačky a při přestřelce jedna narazí do Daedala. Pak skočí do třetího vesmíru, ale tam je ze slunce červený obr a štít se zahřívá a dlouho nevydrží. Navíc narazí na přeživší cizince ze stíhačky a mají plné ruce práce, než je zdolají, protože mají moc tuhý kořínek. Zanedlouho skočí opět, ale z planety je jen pole asteroidů. Dostanou nápad obrátit disk a budou se vracet přes stejné vesmíry až domů. Musí tedy vymyslet plán, jak se dostat na vyšší orbitu červeného obra a poté jak utéci cizí lodi. Vše ovšem není tak jednoduché, jak se zdá a cizinci jim zase ještě více pořádně zavaří…

---

Při návratu z planety, kterou chtějí využít jako stanoviště alfa, najednou Sheppard ztrácí schopnost řízení, dojde k přepětí a Jumper narazí do brány. Ta se stabilizuje, ale Jumper je bezmocný a zanedlouho se rozpadne v atmosféře. Podaří se jim ho ale nakonec zprovoznit a bez dalších incidentů se vrací na Atlantis. Tam později Rodney zjistí podobné přepětí v systémech Atlantis a personál si stěžuje na divné chování systémů. Město se pak najednou úplně vypne. Pak se ale systémy zapnou a začne s nimi komunikovat Weirová, ale jsou trochu skeptický, protože si myslí, že je mrtvá. Ta jim řekne, co se od té doby, co ji nechali na Asuras stalo, že ji opravili, přidala se k frakci a zničení jejich planety jim pomohlo více zkoumat povznesení. To ovšem nešlo, protože jsou stroje, ale Koracen prý přišel na nějaké řešení, odpoutat se od nanitů. Fungovalo to, zbavili se nanitů, ale nyní jsou uvězněni v podprostoru. Snažili se integrovat do systémů jiných ras, ale Atlantis je podle ní jediné místo, kde mohou povznesení dosáhnout. Chce přenést vědomí do těla, ale Woolsey to odmítá. Bere ale vše do svých rukou a vytvoří si znovu Fran s jejím vědomím. Tvrdí, že je to ona, ale nemůže to dokázat, protože by ji ostatní našli. To se ale zanedlouho stane a ostatní směřují na Atlantis. Po příchodu nakonec odříznou expedici od města. Weirová to ale nějak urovná, že jim pomůžou a vymyslí plán postavit si lidská těla, aby se mohli potom povznést. To se ale moc nelíbí Koracenovi a dělá si věci po svém…

---

Kellerová nahrává Rodneyho, který záhadně onemocněl a zapomíná postupně své vzpomínky. Přichází na Atlantis i jeho sestra Jeannie a vysvětlí jí, co se stalo. Má asi 2 dny, než zemře. Šli na planetu M44-5YN, aby našli nezvěstný tým. Tam ale došlo ke globálnímu oteplení, ledovec v blízkosti roztál a skoro zaplavil bránu. Tým volal zpět, aby aktivovali štít a po vypnutí brány pro ně poslali Jumper. McKay ale dostane nějakou horečku a mysleli si, že se vrátil ke svému starému já. Po více jak dnu od nakažení Rodney nahrává s Kellerovou všechno, co ví a dozvídá se také od ní, že to má podobné příznaky, jako Alzheimerova choroba, parazit se mu usadil na mozku a začal růst. Tím začal ztrácet vzpomínky. Mohli by ho chirurgicky odstranit, ale Kellerová nechce riskovat. Ronon se s tím už setkal a má řešení jít do svatyně na Talusu, ale planeta je silně střežena Wraithy. I přes toto riziko to chce Jeannie podniknout. Letí s Jumperem na planetu a je zase záběr z minulosti, jak se Rodney choval a hledal Shepparda. Pak promlouvali na molu o tom, co bude. V současnosti dorazí do svatyně, která je za vodopády, Rodney se začíná cítit divně, ale najednou se vrací do normálu. Zaregistrují tam jakési záření. Posléze zjistí, že záření působí na parazita, který chce před ním uniknout, musí improvizovat a otevřít Rodneymu hlavu a parazita vyndat, než ho zabije…

---

Ženský tým z Atlantis přichází na jednu planetu a prozkoumává jednu jeskyni. Najdou tam laboratoř Michaela. Na Atlantis se Beckett balí, ale Sheppard mu sdělí, co našli a že potřebují pomoc. Cestují na planetu, kde se seznámí s ženským týmem. V laboratoři najdou tucet lidí ve stázi, což byly Michaelovi pokusy pře tím, než stvořil hybridy. Pak se rozdělí a jeden tým se Sheppardem jde prozkoumat místní vesnici. Ta je ovšem opuštěná, ale najdou jednoho vesničana jménem Mirellus a ten jim prozradí, že se začali lidi ztrácet, tak se zbytek odstěhoval. Zůstávají na noc ve vesnici a Sheppard jde pro zásoby do jiné vesnice. Padne mlha a slyší podivné zvuky. Náhle se ztratí Vegová a najdou ji mrtvou. Objeví se další tvorové, nějaké John zabije, ale je jich moc a musí ustoupit. Vrací se do jeskyně a zjistí, že jsou komory otevřené. Zanedlouho jeden napadne Becketta a ten zjistí, že jsou slepí, reagují tedy na zvuk a ze žáber na jejich krku se line ta mlha. Je zachráněn Merhovou, doprovodí ho zpátky, ale zjistí, že Porterová je pryč. Vrací se Sheppard a sdělí jim, co se stalo. Beckett jim taky řekne, co zjistil a nechají ho tam s Mirelluovou a jdou najít Porterovou. Becketta zanedlouho napadnou tvorové a uteče. Sheppard zatím najde Porterovou a nakonec se probojují a všichni se zase setkají. Vymyslí plán nalákat všechny tvory na jedno místo, kde je zabijí. Nejde to podle představ, ale nakonec se jim to podaří. Při návratu do laboratoře ale Sheppard objeví tajné dveře, za kterými je spousta stázových otevřených komor…

---

Tým dorazí s Jumperem na Wraithský mateřský úl, kde jsou uvítáni Toddem. Přišli jim sdělit návrh, že Kellerová vyvinula pomocí Michaelových výzkumů genovou terapii, při které by se pak z Wraithů stali lidé a nemuseli se jimi krmit. Jediné co potřebují, jsou pokusné objekty. Nejprve o tom Todd nechce ani slyšet, ale pak to jdou projednat a souhlasí s podmínkou, že by použili Teylu jako Wraithskou královnu, protože potřebují přesvědčit nejvyšší královnu, aby se to dostalo všem Wraithům, protože jsou rozděleni nyní na frakce. Na Atlantis Kellerová chirurgicky upraví Teylu a Todd jí učí etiketě Wraithů. Když jsou připraveni, letí na setkání. Tam jsou trochu neochotně přivítáni velitelem a hlavní královna nařídí skočit do hyperprostoru. To překvapí tým na druhé lodi, ale musí si důvěřovat, protože Wraithové tvrdí, že neví co se děje. Pak dojde k setkání Teyly s královnou, ale Todd ji zabije a Teyla musí převzít její místo. Moc se jí to nelíbí, ale nemá na vybranou. Sheppard přesvědčí Wraitha, aby je sledovali, a letí za nimi. Loď s Teylou vystupuje z hyperprostoru a přikáže zaútočit, k překvapení Wraithů, na úl nad planetou. Ti ovšem útok opětují a nevypadá to pro ně dobře. Sheppard s Jumperem je vystopují přes bránu a pomůžou jim zničit úl. Zamíří si to k Teyle na loď, protože si myslí, že má problémy. Jsou ale zajati. K překvapení všech je Teyla navštíví a řekne jim, že je vše pod kontrolou, slyší to ale jejich velitel, který pak Teylu konfrontuje. Když to vypadá s ní špatně, přichází Todd a zabije ho…

---

Rodney se nabídne Kellerové, že s ní půjde na M33-985, kde jsou nakaženi nějakým druhem chřipky. Než odejdou, připojí se k nim Ronon, což se moc nelíbí Rodneymu. Na planetě pak Kellerová vyšetřuje jednu rodinu a Rodney s Rononem si odskočí na oběd do hospody. Když se vrátí, domluví se, že se tam pak sejdou, ale Jennifer zmizí a neví kde je. Ta se probouzí spoutaná s jedním mužem, který ji unesl. Ronon je začne stopovat a Rodney chce kontaktovat Atlantis, ale na planetu přichází Wraithové. Nechtěně je upozorní na svou přítomnost, jeden ho dostihne a chce se na něm krmit, ale zakročí Ronon. Ronon si uvědomí, že na planetě musí být štvanec a Wraithové ho loví. Jdou varovat vesnici a ti se ukryjí v jeskyních. Uprchlíky vystopuje Jeden Wraith, ale štvanci se mu ho podaří zabít a Kellerová zjistí pravdu a nabídne mu, odstranit sledovací zařízení. To je ale tentokrát připevněno k páteři a po vyjmutí by zemřel. Ronon je dál na stopě, která je plná pastí a také je napadne Wraith, kterého Rodney zabije. Kellerová se zatím dostává se štvancem do jeskyně, kde je raněná 10tiletá dívka Celise, kterou zachránil před Wraithy a je také důvod, proč Jennifer unesl. Jsou pak napadeni Wraithem, Kiryk (štvanec) je omráčen, ale Kellerová Wraitha zabije a odtáhne je do bezpečí. Jennifer pak vymyslí plán, když se probere, jak přerušit pomocí defibrilátoru spojení. Pak je najdou Ronon s Rodneym a pustí se do sebe. Kellerová to urovná a jsou v zápětí napadeni Wraithy. Podaří se jim je zneškodnit, ale u brány na ně čekají další. Kiryk používá své teleportační zařízení, které Rodney opravil, aby je zaměstnal…

---

Na Atlantis přijíždí Dr. Daniel Jackson, ale McKay není moc nadšený, protože přišel v nevhodnou dobu, jelikož je na stopě tajné laboratoře Januse. Na Daedalus odchází Woolsey na delegaci s Wraithy a později se k nim připojí i Kellerová s Rononem. Danielovi a Rodneymu se podaří přes záznamy asistenta Januse zjistit, kde je tajná laboratoř a najdou způsob, jak do ní vstoupit. Když tak učiní, aktivuje se podprostorové vysílání nějakého zařízení. Na Daedalu se sejdou s Wraithy a začnou společně pracovat na séru. Nad městem se najednou vynoří z hyperprostoru loď, město zapne štít, ale loď jím prochází a tři členové posádky ve zbroji proniknou do města a směřují do Janusovy laboratoře. Sheppard s Teylou je konfrontují, ale zabijí jednoho a zbytek uniká s Danielem, Rodneym a zařízením. Na Atlantis se snaží Zelenka marně dostat do obleku zabitého cizince, a když už je narušen, zapne se autodestrukce a oblek vybuchne. Ztratili šanci identifikovat cizince. Daniela s Rodneym únosci seznamují s Antickým zařízením, které chtějí spustit, jinak Daniela zabijí. Rodney zjistí, že narušuje podprostorovou frekvenci spojenou s wraithským hyperpohonem a ta exploduje při vstupu do hyperprostoru. Musí mít ale vedlejší účinky, když od projektu Janus upustil. Zelenka zatím zjistí, že jsou na planetě M6H-987, ale ta nemá bránu. Mezitím Rodneymu se podaří aktivovat zařízení. Na Daedalu posílá Todd dvě své lodě pryč, ale když explodují při vstupu do hyperprostoru, obviní lidi, že aktivovali Atterovo zařízení a všechny omráčí a přebere kontrolu nad Daedalem. Na Atlantis vytáčí planetu M5R-179, aby kontaktovali Daedala, ale začne se v ní rychle hromadit energie. Posilují štít brány ze štítu města, a když brána vybuchne, výbuch se drží uvnitř, ale štít rychle slábne…

Zbytek energie výbuchu brány při kolapsu štítu vážně poškodí nejvyšší úrovně řídící věže. Teyla se tam vrací se zdravotníky a naštěstí najdou Shepparda se Zelenkou živé. Na Daedalu zatím přebral Todd úplnou kontrolu nad lodí a varuje ostatní Wraithy, aby nevstupovali do hyperprostoru. Zamíří si to k Atlantis, tam je kontaktuje a chce po nich umístění Atterova zařízení, jinak začne zabíjet, počínaje Woolseym. Ti se domlouvají a nakonec jim dají souřadnice. Za chvíli dorazí k Atlantis i Cestovatelé a požadují odpovědi, proč brány v celém Pegasu vybuchují. Řeknou jim o zařízení a ti jim poskytnou loď Katanu a vydají se tam Zelenka se Sheppardem. Na Daedalu zatím jediní volní Ronon s Kellerovou sabotují asgardský systém a Todd vyhrožuje, že začne zabíjet posádku, když se nevzdají. Daniela zatím cizinci odvedou a ukážou mu nakonec svou pravou tvář. Jsou to Asgardi. Na Daedalu zprovozní hyperpohon, ale zbraně jsou nenávratně poškozeny. Todd má ovšem jinou alternativu. Ronon zatím osvobozuje posádku. Katana doráží k planetě Asgardů a začnou střílet na jejich lodě. Zanedlouho přiletí také Daedalus a Sheppard je překvapen, když vidí opět ve velení expedici. Sdělí mu ovšem, že Todd nastavil a uzamkl kurz na základnu, aby zničil zařízení. Před dopadem Katana otevře hyperprostorové okno před Daedalem a zachrání ho. Rodney s Danielem vstupují v oblecích do místnosti se zařízením, aby odpojili krystaly. Daniel ale dostane velký zásah energií. Jsou naštěstí transportováni na Daedalus…

---

Na jedné planetě Dr. Beckett léčí lidi z pozůstatku Hoffanského moru a vypráví Sheppardovi, že tito lidé jsou z planety Belara, která byla zničena, protože přežili mor a jsou hrozbou Wraithů. Najednou slyší křik z vesnice a tam se objeví 9 Wraithů, kteří po vůdci vesnice chtějí uprchlíky z Belary, jinak budou také zničeni. Vesničané o tom diskutují, ale tým jim navrhne jinou možnost, že je přesídlí na jinou planetu do bezpečí před Wraithy. Bránu ale přijde hlídat spoustu Wraithů a nemohou uniknout. Jervis bere vše do svých rukou a se spolupracovníky co stojí za ním, najde Belariany a chce je předat Wraithům. Tým ho pak musí zajmout a uvěznit, ale říká jim, že už jednu skupinu předali. Zbytek ukryjí v dolech. Přilétá úl a Sefaris s nimi uzavře dohodu, protože ví o někom cennějším. Beckett a Rodney jsou tedy zajati a chtějí po Beckettovi, aby dokončil jejich výzkum. Sheppard zpovídá Jevise, kdo je za to odpovědný a řekne mu jen, že Belariané. Na lodi zatím Carson odmítá spolupracovat a velitel se na něm začne krmit, ale padne a umírá. Carson měl v sobě Hoffanský enzym. Na lodi se jim zatím podaří deaktivovat její zbraně a chtějí uniknout oba v jedné šipce. Na planetě zatím Elson osvobozuje Jevise a jeho lidi a jdou za Belariany do dolů. Byla to ovšem promyšlená past a když tam s Wraithy dorazí, vyhodí důl do vzduchu. Nyní už jsou schopni zlikvidovat zbytek Wraithů u brány a všichni uniknou. Na Atlantis Carson dokončuje enzym a najdou planetu pro Belariany…

---

Atlantis je pozvána koalicí různých světů na schůzi, kteří chtějí pomoci v boji proti Wraithům a chtějí, aby se k nim Atlantis připojila, protože jsou již v boji proti nim proslulí. Vydává se tam tedy Sheppardův tým. Po příchodu zjistí, že nechtěli, aby se připojili ke koalici, a posílají je na jinou planetu, kde čelí obvinění „zločiny proti galaxii Pegasus“. Po Sheppardovi chtějí vysvětlit věci, jako třeba probuzení Wraithů, zradu Geniů, existenci Michaela, hybridy a Hoffanský mor, který se nedávno přehnal přes galaxii. Sheppard se ale obhajoval tím, co všechno dokázali, jako třeba zničení mnoho jejich lodí, klonovacího zařízení a také odstranění Michaela, i když přiznal, že by mohl být stále naživu. Je vyslán za nimi tým majora Lorna, ale vrací se, že tam nejsou. Woolsey je pošle zpátky, aby prošetřili nedávno zadávané adresy. Nakonec jsou informováni, co se přihodilo a Woolsey se rozhodne, že tam sám zajde to urovnat, protože má zkušenosti. Na planetě přebírá obhajobu. Když mu sdělí, že Geniové mají zájem o koalici, vymyslí plán a dokonce podplácí jednoho soudce. Obhajoba se mu nakonec podaří a dva z nich přesvědčí. Myrus nepřesvědčí, protože její rodina byla zabita Replikátory a je tedy zaujatá…

---

Ronon je instruován Woolseym, že by měl podávat hlášení, jako ostatní. Moc se mu to nelíbí, ale dostane aspoň diktafon. Rodney s Johnem si hrají s auty, když najedno zhasnou světla. Volá kontrolní místnost, ale nic. Na balkoně si všimnou, že je v celém městě tma, mimo řídící místnosti. Expedice vyšetřuje, proč je vše offline a Teyla se nemůže dostat z ubikace. Najednou se dveře otevřou a je omráčena dvěma postavami. Snaží se dostat do řídící místnosti, ale dveře jsou zavřené. Zelenka potřebuje Rodneyho v laboratoři a později zjistí přes kamery, že v řídící místnosti je Teyla a Michael. Pak je vidět, jak se to stalo. Aktivuje se brána a přilétá Jumper, kolem kterého je energetické pole a když ho rozšíří, všechny omráčí. Michael chce využít Torrena, aby dokončil svůj výzkum a pak zničit Atlantis. Sheppard s Lornem se probourávají s C4 dovnitř, ale Lorne je omráčen a musí ustoupit. Ronon se probudí a podaří se mu s pomocí Banksové dostat přes hybrida ven. Zachraňuje zbylé a musí převzít kontrolu nad městem. Vymyslí plán použít Jumpery, ale musí je Rodney nejdříve opravit. Ronon vyslechne Michaela a zaútočí na něj. Když bojují, Teyle se synem se podaří uniknout a schovat, Woolsey je omráčen a Michael nakonec Ronona shodí přes zábradlí. Spustí autodestrukci a chce vylákat Teylu z úkrytu. Mají 10 minut. Nakonec zjistí, že mohou deaktivovat štít brány. Rodney tedy vyletí s Jumperem, Zelenka deaktivuje štít a zadá náhodnou adresu. Nestabilní vír zničí kus jumperu a deaktivuje omračující pole. Zároveň zruší autodestrukci. Nyní už mohou vtrhnout do velína a Michael se snaží utéci k Jumperům. Ronon pak podá hlášení. Je v něm jen toto: „Hlášení z mise: Michael obsadil Atlantidu, pokusil se ji zničit, zastavili jsme ho, konec hlášeni“. Woolsey se jen usměje…

---

Sheppard je unesen, a když se probere z bezvědomí, zjistí, že je v lese na pevnině nové domovské planety Atlantis. Ruce a nohy má svázané a snaží se osvobodit o ostré skály. Zpátky ve městě se Woolsey setkává v přepravní místnosti s novou členkou expedice, která se představí, jako Dr. Vanessa Conradová, a která dorazila na Apollu. Woolsey jí začne vyprávět o pravidelných společenských aktivitách na Atlantis. Padnou si nějak do oka. Mezitím se Sheppard osvobodí a vrací se ke svému Jumperu, ale zjistí, kdo ho svázal. Je to Kolya, kterého zabil před dvěma roky. Na Atlantis také přichází členka IOA a chtějí odvolat Woolseyho, ale ten se bez boje nechce vzdát. Na Atlantis všechny čeká šokující objev prastaré rasy, která je s nimi na planetě. Ukáže se, že Vannesa je vlastně projevem umělé inteligence této rasy, která se jmenuje Sekkari. Oni hledali vhodnou planetu pro svou populaci, ale selhání způsobilo, že skončili zde na M35-117, která pro ně nebyla vhodná. Pozorovala expedici několik týdnů, aby zjistili, zda jsou důvěryhodní. Požádá pak o pomoc. Současně Sheppard padá do propasti po úniku od mučení Kolyy a má jednu ruku uříznutou. Ten ho ovšem vytáhne a zmatený Sheppard se taky dovídá, že to není Kolya, ale projev umělé inteligence rasy, která tu ztroskotala, a nechtěli mu ublížit, jen chtěli vědět, jak bude v takové situaci reagovat a jestli se jim může věřit. Poté také pomůžou Woolseymu v hodnocení, který zůstává velitelem expedice a nachází pro ně vhodnou planetu…

---

Dr. McKay je pozván bývalým přítelem Malcolmem Tunneyem a soupeřem ze školních let na jeho prezentaci nové technologie. Rodney s sebou bere na Zemi i Kellerovou. Cestovali spolu do tajného soukromého zařízení Malcolma. Bude tam provádět demonstraci nové technologie a bude to také sloužit, jako párty pro desítky bohatých a významných hostů. McKay a ostatní hosté jsou si vědomi, že někteří jeho kolegové varují před možnými katastrofálními následky, ale i přes to zařízení aktivují a dojde k poklesu teploty v místnosti. Zdá se, že je to jakési zařízení na ovládání počasí, což je geniální řešení na globální oteplování. Dav jásá, ale Malcolm je brzy informován, že zařízení nelze vypnout a všichni jsou nyní uvězněni v budově a jsou v nebezpečí. Ukáže se, že Malcolm postavil most, který odvádí teplo do jiné reality a s něčím podobným se Rodney se svou sestrou již setkal, když se něco podobného snažili vytvořit, ale byl problém s vypnutím. Malcolm to po něm převzal a bez ohledu na varování si sestavil svůj. Teplota stále rapidně klesá. McKay naverbuje vědce a snaží se problém vyřešit. Kellerová zatím volá do SGC o pomoc, ale je uvězněna v místnosti, kde mrznoucí blesk zmrazí dveře a navíc tam začne téct ledová voda. Po neúspěchu přetížení mostu se Rodney rozhodne otevřít další a přimět je ke zhroucení. Dovídá se ale, že má Jennifer potíže a jde ji na pomoc. Vědci to musí dokončit sami. Nakonec se mu ji podaří zachránit a vědci úspěšně aktivují druhý most a oba se zhroutí. Pak si Rodney a Kellerová přiznají své pocity…

---

Sledovaná wraithská mateřská loď vystoupí z hyperprostoru nad Atlantis, kde zavedou preventivní obranná opatření. Po zhlédnutí velmi poškozeného video souboru se tým vydává Jumperem na loď, aby to prozkoumal. Zjistí, že je opuštěná a všichni Wraithové jsou ve stázi. Zdá se, že jsou zasaženi nějakou chorobou, kterou částečně způsobila genová terapie Kellerové a zasáhlo to i systémy lodi. Přilétá také tým majora Lorna. Kellerová zjišťuje, že vše šlo podle plánu, ale když byl imunitní systém nejslabší, aktivoval se smrtící virus a nemá představu, jak ho odstranit. Na lodi zatím dochází ke stále větším výkyvům a změnám a rozhodnou se neriskovat a opustit loď, protože navíc probouzí náhodně Wraithy. Při cestě zpět ale zjistí, že se tam vytvořila nová stěna a za ní byla chodba úplně zničena. Rozhodnou se tedy oživit Todda a zjistí, jak se loď nakazila. Chtějí deaktivovat komory, ale když se jim to podaří, už je několik desítek Wraithů volných a mají hlad. Snaží se je zastavit. Mezitím Todd s Kellerovou přijdou na řešení, ale potřebují Iratuského brouka. Todd chce za nimi letět, ale nepovolí mu to a zavřou ho. Bojují nadále se zbývajícími Wraithy, ale loď ztrácí rychle integritu a v polovině se rozlomí. Přední část s týmy padá na planetu. Nemohou zastavit pád a musí využít pomoc Todda, který odpaluje rakety, aby ji trochu stabilizoval, než dopadne do oceánu. Než se vrak potopí, jsou zachráněni a posléze se rozhodou Todda pustit hledat Iratuského brouka…

---

V hale stojí dezorientovaná žena v obleku Kellerové a narazí na Zelenku. Ten si myslí, že je jí špatně a odvádí ji na ošetřovnu. Ona ale popadne kleště, bodne ho a v zrcadle je vidět, že je to Kellerová. Při odchodu z laboratoře potká Rodneyho a zanedlouho jim sdělí, že je Zelenka vážně zraněn a potřebují Kellerovou na chirurgický zákrok. Ona se ale vymlouvá, že jí je špatně a potřebuje si lehnout. Beckett ji prohlídne a zjistí, že ji nic není a asi trpí duševní nemocí. Vyplíží se z ošetřovny do hangáru Jumperů a najde tam zbraň. Překvapí ji Rodney, chce ho svézt a chce odvézt na pevninu. Snaží se ji ale dostat na ošetřovnu, když na něj vytáhne zbraň. Přijde ovšem Ronon a omráčí ji. Nakonec se přizná, že je Neeva, se svými komplici ukradli nějaké starobylé zařízení, když se najednou ocitla v těle Kellerové. Rodney potvrzuje, že by se mohlo jedna o antické komunikační zařízení a přesvědčí ji, že dají všechno do pořádku, když jim řekne, kde byli, když se to stalo. Zatím Kellerovou v těle Neevy zatknou vesničané a chtějí ji popravit. Zachrání ji ale její komplicové. Pak se setkají a Neeva chce vysvětlit situaci, ale nevěří ji a vrací se do jeskyně, kde jsou ovšem přepadeni vesničany, jeden komplic je zabit, Neeva postřelena a druhý uniká s Kellerovou. Ve vesnici se potom Beckettovi podaří vyjmout kulku z Neevy a deaktivují spojení zrovna ve chvíli, kdy druhý komplic pojal už podezření a vytáhl na Kellerovou zbraň a vystřelil…

---

Policejní detektiv z Las Vegas John Sheppard přichází k místu činu v poušti, kde nalezli už osmou oběť, které jsou seschlé a se specifickým zraněním na hrudníku. Pitvu provádí Kellerová a nenachází kolem rány žádnou radiaci. Sheppard si ale myslí, že klíčem k chycení vraha je nemoc z ozáření. Později je vidět, jak se natahuje Wraith na nějakého chlapa, kterému je špatně. Za Sheppardem přichází agend FBI Woolsey, který od něj chce spolupráci, ale tomu se nechce a nic prý neví. Pak dostane konečně nějakou informaci o člověku, který navštívil nemocnici a vykazoval příznaky nemoci z ozáření. Dostane tip a vydává se na poker, kam přijde také maskovaný Wraith za člověka a pořád vyhrává. Obviní ho a on utíká. Před zmateným Sheppardem skočí z 30 metrové výšky a odejde. V motelu nachází mrtvého člověka a pytel peněz. Přijíždí Woolsey, který mu prozradí, že není z FBI a bere ho do Oblasti 51, kde se setkává s McKayem. Ten mu vypráví o všem, co se stalo, o Atlantis, galaxii Pegasus, navštívení jiné reality a potkání jeho samotného a Wraithech, jak také napadli Zemi. Jeden asi přežil a snaží se dát Wraithům z jiných realit polohu Země. Pak ho pustí, dá mu na sebe kontakt a ten se rozhodne vzdát se své práce a jde za novým životem, ale přemýšlí, co mu Rodney říkal. Mezitím v Oblasti 51 se snaží podle záření Wraitha lokalizovat, ale Rodney má telefon a Sheppard mu řekne, že něco našel, protože si něčeho všiml v motelu. Lokalizují ho a posílají dvě letadla. Sheppard tam ovšem jede a Wraith si ho všimne a skoro zabije, když si všimne letadel a spěchá zapnout vysílač. Na konci zjistí, že než byl karavan zničen, podařilo se mu poslat informace…

---

Atlantis kontaktuje Todd, který jim sdělí, že jeho podřízený Kenny s Wraithy se vzbouřili a použili ZPM získané z bitvy o Asuras na stavbu nového mateřského úlu a je třeba ho zničit, než bude pozdě. Vydávají se za nimi s Daedalem a vysílají zamaskovaný Jumper. Jsou ale překvapeni, když i přes maskování je detekují a začnou na ně střílet. Asgardské zbraně Daedala nejsou moc účinné a je také poškozen. Najednou wraithská loď skočí do hyperprostoru. Jsou udiveni, že jen tak odletěli, ale zachytí podprostorovou zprávu z jiné reality, ve které je umístění Země. Jsou šokováni a vrací se na Atlantis, aby je varovali. Dostanou ale zprávu, že lodě Sun-Tzu a Apollo jsou vážně poškozeny a rozhodnou se, že jim přiletí na pomoc s celým městem. Od Todda získají další ZPM a mají teď plnou sílu. Carson řídí loď a Sheppard prochází bránou do SGC, aby pomocí platformy nalezené v Antarktidě bránil Zemi. Na Zemi jsou překvapeni, protože přiletěli brzo a šipkami zaútočili na Oblast 51, kde je nyní umístěná platforma. Vylétají s F-302, ale i tak se jim podaří jedinou zbraň k obraně zničit. Hodnostáři IOA chtějí uniknout na stanoviště alfa, ale nyní je dominantní brána v úlu. Sheppard chce infiltrovat s F-302 a dvěma atomovými zbraněmi úl a bomby tam odpálit. Mezitím Atlantis musí vyskočit z hyperprostoru, a když se snaží kontaktovat Zemi, dostanou se na úl, čehož využijí a posílají tam tým. Zelenka potom navrhne využít experimentální pohon červí díry, který je ale nebezpečný. Dostanou se tak na Zemi během pár vteřin. Sheppard proniká na úl a zapojuje se s týmy do bitvy. Ronon je ale bodnut a nechávají ho tam. Atlantis přilétá k Zemi a začnou střílet na úl. Kenny oživuje Ronona a tým se ho snaží zachránit. Střelba z úlu narušila orbitu Atlantis, ale místo toho, aby to srovnali, střílí dále. Nakonec Sheppard odpaluje bomby a unikají na stanoviště Alfa. Atlantis sestupuje atmosférou po moc strmé dráze a nemají s ní spojení…