Nejen o Stargate Atlantis ale i spoustu novinek o celém fenoménu Stargate
Seriál Hvězdná brána Atlantida navazuje na původní seriál Hvězdná brána. Po první tři sezóny seriálu běželi oba společně vedle sebe, přičemž v několika epizodách lidí z Atlantidy zavítali na Zemi a lidé z Velitelství zase na Atlantidu.
V seriálu jde především, jak už název seriálu napovídá, o ztracené město Atlantis. Na Zemi sestaví expedici, která projede branou s osmi symboly do jiné galaxie. V této galaxii, kterou nazývají Pegasus, se nachází ztracené, potopené a uspané město Atlantida. Po probuzení města se expedice seznamuje s novými hrozivými nepřáteli, kteří porazili i samotné Antiky. Bez možnosti návratu na Zemi se ocitají v jiné galaxie uvězněni na daleké planetě, čelící strašlivému nepříteli, který touží vysát jejich životy.
Stejně jako v původním seriálu i tento spin-off má svůj hlavní tým – AR-1. Tento tým se skládá z majora Johna Shepparda, Dr. Rodneyho McKaye, Teyly Emmagam a Ronona Dexe. V minulosti do týmu patřil také Aiden Ford. K týmu se občas připojil také Dr. Carson Beckett, který často zachraňoval životy a zkoumal různé mimozemské léky. Společně se tento tým vydává vstříc dobrodružstvím v Pegasu, objevováním Antických tajemství, či navazováním nových spojeneckých vztahů s nejrůznějšími civilizacemi.
Ve velení expedice Atlantis se také vystřídalo několik lidí. Během prvních třech sezón seriálu byla ve velení Dr. Elizabeth Weirová. Civilistka, která byla uznávaná celým personálem. Po vážném zranění při opouštění planety Lantea byla vážně zraněna a v následujícím konfliktu s replikátory zachránila Sheppardův tým tou nejvyšší cenou – smrtí. Po doktorce Weirové velila plukovnice Samantha Carterová, se kterou jsme se setkali v původním seriálu. Po jedné sezóně je však nahrazena Richardem Woolseym, kterého na její místo dosadila IOA.
Pro expedici Atlantis jsou největší nepřátelé Wraithi. Díky početní převaze dokázali porazit i pošetilé Antiky. Po porážce Antiků začali opět hibernovat, jenže po příchodu expedice Atlantis do galaxie Pegasus byli probuzeni a tak musí expedice čelit velmi vážné hrozbě.
Wraithové jsou humanoidé, kteří žijí v galaxii Pegasus, kam se vydali Antikové se svým létajícím městem Atlantida. Wraithové vznikli mutací lidské DNA a DNA eratuského brouka. Díky této mutaci získali Wraithové telepatické schopnosti a vysokou schopnost regenerace. Wraithové se krmí pomocí své krmné ruky. Díky ní vysávají z lidí životní energii a tím se krmí.
Wraithové zotročili mnoho světů v Pegasu. Sklízejí na nich lidi, které šipky převezou do úlu a poté se na nich Wraithové krmí. Mnoho světů bylo v Pegasu postiženo Wraithy, většina civilizací je velmi primitivní. Elizabeth Weirová, coby replikátor v subprostoru, také řekla expedici o mnoha vyspělých civilizací, které se před Wraithy skrývají na svých planetách.
Wraithi se pro Antiky brzo stali vážnou hrozbou. Jejich počet rychle rostl, jejich lodě nabírali na velikostech. Antikové, ve snaze dojednat mír, posílali hluboko do Wraithského území lodě třídy Aurora, které však Wraithové buďto zničili, nebo se nakrmili na posádce a technologii lodí použili ke zdokonalení své vlastní. Antikové brzy pochopili, že Wraithové jsou příliš mocní. Jejich území se rychle zmenšilo a Wraithové se brzy dostali až k Atlantidě. U planety Lantea, kde sídlila Atlantida, se strhla obrovská bitva, ve které byli Antikové poraženi. Potopili Atlantidu do oceánu a odešli Hvězdnou Bránou zpět na Zemi. Po deseti tisíci letech však na Atlantidu přišli lidé ze Země a Wraithy probudili. A tak se vydává tato expedice opět do boje s Wraithy. Díky své snaze a dokonalému pochopení situace dokázala tato expedice nekolikrát účinně Wraithy zničit. Jejich počet se zmenšuje, přesto mezi nimi zuří občanská válka.